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綜合信息處：
1.擬訂四川自貿試驗區發展規劃和計劃，組織研究四川自貿試驗區發展重大問題。
2.統計發布四川自貿試驗區相關公共信息，綜合評估四川自貿試驗區運行情況。
3.承擔四川自貿試驗區經驗複製推廣以及推動自貿試驗區與成都平原、川東北、川西北、川南和攀西等五大經濟區協同聯動等工作。
4.負責四川自貿試驗區推進工作領導小組例會的組織實施。
製度創新處：
1.擬訂四川自貿試驗區法規規章和規範性文件，建立健全法規政策製度。
2.研究推動出台並指導實施四川自貿試驗區綜合改革、投資、貿易、金融、人才等政策。
3.承擔對國內外自由貿易試驗區的分析研究，組織實施四川自貿試驗區的對外宣傳、交流研討等工作。
4.負責配合國家有關部門落實國家安全審查、反壟斷審查。
5.指導各片區做好政策法規相關配套製度建設工作。
協調指導處：
1.承擔四川自貿辦公文運轉、日常管理和對外聯絡工作。
2.承擔與國家、省相關部門以及四川自貿試驗區各片區有關自由貿易試驗區事務的統籌協調。
3.負責與各片區管理機構聯絡工作，推動各片區建立健全事中事後監管體係。
4.指導督促檢查四川自貿試驗區各項試驗任務的落實以及四川自貿試驗區目標管理、考評表彰等工作。