两江自贸法院与四川自贸区法院在线签署《川渝自贸区法院合作共建协议》，在全市法院率先开启成渝司法合作，将以川渝两地自贸区司法实践为基础，加强对涉及自贸区对外贸易、知识产权保护、金融创新等重点领域法律问题的研究，重点探索国际货物多式联运、跨国铁路单证等国际物流规则，推动完善自贸区法治规则体系，努力为自贸区制度创新提供法治保障。
2018年12月24日，两江新区（自贸区）法院作为全国首家覆盖自贸区全域的人民法院，正式挂牌成立。目前集中管辖自贸区内企业之间的投资、贸易、金融纠纷，以及自贸区内一方当事人为外商投资企业的商事纠纷。
为实现诉讼便民，两江自贸法院积极打造智慧法院，常态化网上立案，通过重庆法院“易诉”平台、“重庆易法院”手机APP等信息化载体，整合网上诉讼服务功能，2019年全年网上立案率达80.91%，在全国法院居于领先水平。
此外还加快建设现代化诉讼服务中心，提供跨区域无障碍自助立案服务，提高现场立案效率，平均登记立案时间为8分钟/案。据了解，其自主研发的律师庭审智能识别引导系统和诉讼信息智能推送系统已正式取得计算机软件著作权登记证书，成为全市首个法院自主研发并拥有知识产权的智能诉讼服务系统。
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